Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm23531-201ENSMUST00000104567 68 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm22425-201ENSMUST00000158532 138 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm43199-201ENSMUST00000200019 307 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm18691-201ENSMUST00000203593 872 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm24208-201ENSMUST00000082783 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Snord118-201ENSMUST00000082965 135 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Ccdc18Q640L5 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm26236-201ENSMUST00000175536 137 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm38274-201ENSMUST00000195689 148 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm45207-201ENSMUST00000207469 145 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC0.96□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm23172-201ENSMUST00000157160 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm3952-201ENSMUST00000195093 573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm43708-201ENSMUST00000198857 961 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm35736-201ENSMUST00000203681 313 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm25788-201ENSMUST00000082721 131 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm22537-201ENSMUST00000158172 199 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm25491-201ENSMUST00000158733 308 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm23020-201ENSMUST00000158766 253 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm20118-201ENSMUST00000187207 162 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm43090-201ENSMUST00000202459 314 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm21937-201ENSMUST00000222825 218 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Mir196a-2-201ENSMUST00000083554 85 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm14907-201ENSMUST00000121948 854 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Mup1-201ENSMUST00000084548 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Zfp40-203ENSMUST00000140313 2754 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm16162-201ENSMUST00000162296 297 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm35548-201ENSMUST00000214348 441 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm11483-201ENSMUST00000119839 247 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Mir653-201ENSMUST00000102402 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Mir6238-201ENSMUST00000184140 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Trav12-4-201ENSMUST00000200663 271 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
Ccdc18Q640L5 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Mir1967-201ENSMUST00000157789 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm26378-201ENSMUST00000179093 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Mir7077-201ENSMUST00000183991 57 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 1700022E09Rik-201ENSMUST00000185295 299 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Vmn1r237-201ENSMUST00000077301 950 ntAPPRIS P1 BASIC0.9□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm22515-201ENSMUST00000158273 305 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 AC115047.1-201ENSMUST00000213795 322 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm21518-201ENSMUST00000178115 567 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm20736-201ENSMUST00000178198 567 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm20843-201ENSMUST00000178505 567 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Ccdc18Q640L5 Gm21209-201ENSMUST00000178556 567 ntTSL 5 BASIC0.88□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132 ms