Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm25111-201ENSMUST00000116686 147 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm24835-201ENSMUST00000116777 111 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22242-201ENSMUST00000175224 118 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm43521-201ENSMUST00000197838 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm43107-201ENSMUST00000198729 255 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Trav15n-3-201ENSMUST00000200498 168 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Igkv4-60-201ENSMUST00000200639 358 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1102-202ENSMUST00000214002 1806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr657-203ENSMUST00000215454 2397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Nexn-207ENSMUST00000198460 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm28358-202ENSMUST00000189292 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm28271-201ENSMUST00000191369 351 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44161-201ENSMUST00000203532 253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AL929417.1-201ENSMUST00000214901 124 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 2610044O15Rik8-201ENSMUST00000079272 264 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Snord68-201ENSMUST00000082516 86 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1002-201ENSMUST00000099920 957 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr592-202ENSMUST00000106893 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22668-201ENSMUST00000158716 260 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm3370-201ENSMUST00000171785 500 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm23003-201ENSMUST00000179948 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Nras-ps2-201ENSMUST00000195269 178 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC130222.1-201ENSMUST00000221198 256 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC124537.1-201ENSMUST00000222890 159 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC125311.1-201ENSMUST00000226950 220 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm10324-201ENSMUST00000092528 1815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm37642-201ENSMUST00000193166 1735 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr898-203ENSMUST00000217063 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm11798-201ENSMUST00000119150 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm23402-201ENSMUST00000178130 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm25284-201ENSMUST00000180345 141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Ssbp4Q3U4B1 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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