Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm25168-201ENSMUST00000104189 132 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm24736-201ENSMUST00000158862 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm17919-201ENSMUST00000173344 312 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm20672-201ENSMUST00000176605 261 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Ighv1-28-201ENSMUST00000192987 351 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AC118639.1-204ENSMUST00000226401 694 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Zfp729b-201ENSMUST00000012873 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Vmn2r68-201ENSMUST00000061074 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Olfr509-202ENSMUST00000213756 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Olfr25-203ENSMUST00000214155 6479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Rpl36a-ps3-201ENSMUST00000120093 321 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm12617-201ENSMUST00000121268 381 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm24213-201ENSMUST00000158255 258 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AL603834.1-201ENSMUST00000198372 121 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AC102369.1-201ENSMUST00000218415 373 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Snord104-201ENSMUST00000083192 70 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm14678-201ENSMUST00000121396 482 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 4930527E20Rik-201ENSMUST00000135700 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm27783-201ENSMUST00000183534 105 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Olfr1556-ps1-201ENSMUST00000204688 466 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm26111-201ENSMUST00000083969 106 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Olfr807-202ENSMUST00000213379 1866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm15029-201ENSMUST00000119742 199 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Mup-ps22-201ENSMUST00000121611 243 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm26477-201ENSMUST00000122617 323 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm12976-202ENSMUST00000153817 412 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm22791-201ENSMUST00000157232 145 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm24192-201ENSMUST00000157978 145 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm24264-201ENSMUST00000179835 94 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Mir6353-201ENSMUST00000183596 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AC138401.1-201ENSMUST00000221533 116 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Sh3bp1P55194 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm24737-201ENSMUST00000158861 100 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Sh3bp1P55194 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 762.2 ms