Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Vmn1r215-202ENSMUST00000228092 2790 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm12071-201ENSMUST00000121968 469 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm13667-201ENSMUST00000132332 617 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm24503-201ENSMUST00000158454 135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm43304-201ENSMUST00000196803 326 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm42990-201ENSMUST00000199231 312 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Zfp950-204ENSMUST00000143264 4825 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Olfr1101-202ENSMUST00000214411 3235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Olfr1185-ps1-201ENSMUST00000075025 3344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm7173-201ENSMUST00000101410 2832 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Olfr1507-203ENSMUST00000206062 2803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm12252-201ENSMUST00000119517 219 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm25177-201ENSMUST00000122634 117 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Mir713-201ENSMUST00000178651 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm44320-201ENSMUST00000199276 86 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm42844-201ENSMUST00000200355 112 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm44032-201ENSMUST00000204841 166 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 AC165106.2-201ENSMUST00000226749 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Rpl32-ps-201ENSMUST00000091052 506 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Mir488-201ENSMUST00000093595 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Olfr1252-203ENSMUST00000216203 3243 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Ankrd28-204ENSMUST00000227089 3522 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Rbm41-204ENSMUST00000113011 3728 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 AC144772.3-201ENSMUST00000228829 3126 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Olfr1130-201ENSMUST00000213103 2643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm15226-201ENSMUST00000156526 2971 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Mir6418-201ENSMUST00000185075 115 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm28434-201ENSMUST00000187738 500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm38088-201ENSMUST00000195829 241 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Trav5-2-201ENSMUST00000199855 280 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Olfr556-202ENSMUST00000213485 3825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm23462-201ENSMUST00000083264 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Ckap5-204ENSMUST00000111338 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm19744-204ENSMUST00000188936 4533 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Olfr646-202ENSMUST00000214099 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Cul4b-203ENSMUST00000115118 3344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Vmn1r169-202ENSMUST00000226669 2326 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm25980-201ENSMUST00000157176 218 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm14295-203ENSMUST00000179435 192 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm44932-201ENSMUST00000206799 121 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm24453-201ENSMUST00000083346 76 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Igsf10-202ENSMUST00000193455 8484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
PtpreP49446 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Klhl15-204ENSMUST00000113915 6241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Spink5-201ENSMUST00000069245 4785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Igsf10-201ENSMUST00000039419 10084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Gm37478-201ENSMUST00000193624 3495 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Olfr1044-202ENSMUST00000215171 3266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Olfr980-202ENSMUST00000216463 3050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Gm24403-201ENSMUST00000104616 130 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Gm23713-201ENSMUST00000157353 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Gm26482-201ENSMUST00000158015 62 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Gm22615-201ENSMUST00000158102 70 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
PtpreP49446 AC120540.2-201ENSMUST00000221716 387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms