Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28744-201ENSMUST00000189939 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Ighv1-32-201ENSMUST00000195149 351 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC140477.1-201ENSMUST00000222354 246 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 mt-Atp6-201ENSMUST00000082408 681 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23247-201ENSMUST00000083373 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15084-201ENSMUST00000178585 1502 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC153967.1-201ENSMUST00000219333 3190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm381-201ENSMUST00000117443 2037 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24627-201ENSMUST00000122764 138 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15205-201ENSMUST00000129329 632 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm37771-201ENSMUST00000193121 265 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm43140-201ENSMUST00000197317 456 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm19032-201ENSMUST00000208584 592 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm18774-201ENSMUST00000218269 601 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm6954-201ENSMUST00000117416 225 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24075-201ENSMUST00000158175 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Rpl30-ps2-201ENSMUST00000160070 291 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Obox1-203ENSMUST00000172881 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Vmn2r-ps19-201ENSMUST00000179720 269 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24518-201ENSMUST00000180275 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm27249-201ENSMUST00000185049 328 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm27369-201ENSMUST00000185182 71 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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Ccl20O89093 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm43487-201ENSMUST00000200331 1031 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
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Ccl20O89093 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr1161-201ENSMUST00000054845 1012 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm36944-201ENSMUST00000192257 2759 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr630-201ENSMUST00000106880 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23747-201ENSMUST00000104228 131 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm24237-201ENSMUST00000157790 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Mir3075-201ENSMUST00000175340 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm5329-201ENSMUST00000186898 463 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC122225.1-201ENSMUST00000215641 369 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 AC129208.2-201ENSMUST00000228506 320 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Snord14d-201ENSMUST00000083424 86 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Ccl20O89093 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
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