Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Clec5a-203ENSMUST00000129948 858 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Krtap27-1-201ENSMUST00000165580 646 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Mir9-1-201ENSMUST00000199907 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Igkv13-71-1-201ENSMUST00000199934 264 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm6842-201ENSMUST00000211361 390 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm2436-201ENSMUST00000219562 774 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 AC166358.10-201ENSMUST00000220556 144 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr1161-202ENSMUST00000214438 3675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Vmn2r81-201ENSMUST00000020547 3276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr65-201ENSMUST00000106864 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm13661-201ENSMUST00000154297 318 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm17036-201ENSMUST00000168187 254 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm26844-201ENSMUST00000181690 673 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm6059-201ENSMUST00000196903 340 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm44633-201ENSMUST00000205925 439 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm29521-204ENSMUST00000216859 279 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC159619.2-201ENSMUST00000222924 401 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC122418.1-201ENSMUST00000225012 511 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm23517-201ENSMUST00000082830 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Vmn1r185-211ENSMUST00000228467 6915 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm22656-201ENSMUST00000104199 171 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm20718-201ENSMUST00000176058 259 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm29352-201ENSMUST00000188054 544 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm33354-201ENSMUST00000195448 906 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr499-ps1-201ENSMUST00000208811 930 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC122393.3-201ENSMUST00000226343 1059 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm26573-201ENSMUST00000181199 3020 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm38083-201ENSMUST00000194758 3498 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir743b-201ENSMUST00000104751 77 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm12213-201ENSMUST00000119924 353 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm12155-201ENSMUST00000121267 160 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm12872-201ENSMUST00000121835 320 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Vmn1r-ps9-201ENSMUST00000177047 358 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Opn1mwO35599 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
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