Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm45941-202ENSMUST00000223144 389 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Olfr1016-202ENSMUST00000216425 2698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm43256-201ENSMUST00000199995 3091 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
ArxO35085 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm8790-201ENSMUST00000194108 322 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Mir3068-202ENSMUST00000197755 79 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC127270.2-201ENSMUST00000221337 247 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC124581.4-201ENSMUST00000225874 463 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm26447-201ENSMUST00000082448 129 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Mir26a-1-201ENSMUST00000083579 90 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Mgat4c-211ENSMUST00000163753 3862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
ArxO35085 Gm14327-202ENSMUST00000108935 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm23941-201ENSMUST00000101953 107 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm14402-201ENSMUST00000122217 508 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm22320-201ENSMUST00000157149 312 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm25572-201ENSMUST00000157527 172 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm42621-201ENSMUST00000198114 275 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm35702-201ENSMUST00000198653 511 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Olfr1370-201ENSMUST00000058168 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Olfr406-203ENSMUST00000217016 2651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm8995-201ENSMUST00000184842 7280 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 AC159193.2-201ENSMUST00000220865 4251 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Vmn1r67-202ENSMUST00000226237 2352 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Olfr215-201ENSMUST00000061723 4112 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
ArxO35085 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Smt3h2-ps4-201ENSMUST00000121569 288 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm23391-201ENSMUST00000157579 104 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm24487-201ENSMUST00000178017 63 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm27402-201ENSMUST00000183890 120 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm37923-201ENSMUST00000191624 161 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm43286-201ENSMUST00000197420 424 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Rps24-205ENSMUST00000223999 525 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
ArxO35085 Olfr1196-203ENSMUST00000216977 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm23759-201ENSMUST00000158351 268 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm17133-201ENSMUST00000170636 289 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 AC154297.1-201ENSMUST00000171334 397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Vmn2r-ps65-201ENSMUST00000173309 220 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm25817-201ENSMUST00000177758 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm24766-201ENSMUST00000179182 121 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Mir6355-201ENSMUST00000183687 106 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm27773-201ENSMUST00000184087 78 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm44960-201ENSMUST00000207403 141 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Mir29b-2-201ENSMUST00000083478 81 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 AC122850.1-201ENSMUST00000220380 5690 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gpr174-204ENSMUST00000120971 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm16332-201ENSMUST00000134229 2967 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Erbin-205ENSMUST00000188997 5084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm24898-201ENSMUST00000158133 106 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm42570-201ENSMUST00000195937 292 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm46998-201ENSMUST00000221444 330 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Sprr4-201ENSMUST00000062129 231 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm44164-201ENSMUST00000203605 2561 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ArxO35085 Xiap-201ENSMUST00000026978 6834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm23202-201ENSMUST00000104376 129 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ArxO35085 Gm25454-201ENSMUST00000157947 315 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms