Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm15272-201ENSMUST00000120865 233 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm26255-201ENSMUST00000122492 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm24635-201ENSMUST00000122712 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm23725-201ENSMUST00000177876 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm37313-201ENSMUST00000191673 290 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm44468-201ENSMUST00000199516 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm44041-201ENSMUST00000203678 396 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm45375-201ENSMUST00000210338 280 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 CAAA01090905.1-201ENSMUST00000219056 426 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm26446-201ENSMUST00000082455 103 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Fam71d-201ENSMUST00000077968 1772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 n-R5s202-201ENSMUST00000104517 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm24443-201ENSMUST00000157242 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm25243-201ENSMUST00000174912 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Snord93-201ENSMUST00000175580 71 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm26430-201ENSMUST00000178054 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm25175-201ENSMUST00000178712 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Bsph2-ps-201ENSMUST00000183795 241 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm29414-201ENSMUST00000185379 448 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Mir452-201ENSMUST00000093629 85 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Vmn1r185-206ENSMUST00000227479 6525 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm11322-201ENSMUST00000118095 435 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm27013-201ENSMUST00000182441 1024 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm29350-201ENSMUST00000189141 541 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm45452-201ENSMUST00000210905 177 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm23423-201ENSMUST00000082782 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Zbtb37-203ENSMUST00000162226 18814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir759-201ENSMUST00000103254 98 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm13210-201ENSMUST00000121483 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm15065-201ENSMUST00000121699 273 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Cldn4O35054 Mir7014-201ENSMUST00000183853 63 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 156.9 ms