Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Gm28449-201ENSMUST00000187655 506 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm7837-201ENSMUST00000190873 412 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm20083-201ENSMUST00000205849 751 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm44938-201ENSMUST00000208614 427 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm44808-201ENSMUST00000208887 264 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm45488-201ENSMUST00000210747 371 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Olfr974-202ENSMUST00000213246 3561 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Rpl23a-ps10-201ENSMUST00000185511 462 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Mir7215-201ENSMUST00000200383 51 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 AC111044.1-201ENSMUST00000220206 555 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Il1rapl1-202ENSMUST00000113964 1936 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Zfp980-202ENSMUST00000180014 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Cyp3a59-201ENSMUST00000035571 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Rps15a-ps6-201ENSMUST00000117476 393 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Cox20-ps-201ENSMUST00000119872 353 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm22527-201ENSMUST00000158816 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm44083-201ENSMUST00000203114 337 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Olfr138-201ENSMUST00000071871 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm29106-201ENSMUST00000186264 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Olfr711-203ENSMUST00000216335 4724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm11389-201ENSMUST00000121407 430 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 1700019A02Rik-202ENSMUST00000190748 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm44133-201ENSMUST00000203823 701 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Gm15303-201ENSMUST00000118676 2624 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 AC125374.3-201ENSMUST00000214983 2810 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Eftud2O08810 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.9 ms