Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm26071-201ENSMUST00000083261 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm24521-201ENSMUST00000083958 107 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC152159.1-201ENSMUST00000226719 2769 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr1197-202ENSMUST00000213118 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Neto2-201ENSMUST00000109686 5610 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Hdx-201ENSMUST00000038472 9385 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Cfh-203ENSMUST00000111977 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mmrn1-201ENSMUST00000129603 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Dst-203ENSMUST00000115104 23279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Fam19a1-202ENSMUST00000122120 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Igkv4-69-201ENSMUST00000103349 348 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm24116-201ENSMUST00000103975 107 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm13992-201ENSMUST00000120558 156 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm28020-201ENSMUST00000157739 67 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm24006-201ENSMUST00000158462 132 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm2962-201ENSMUST00000159266 336 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm28825-201ENSMUST00000186233 238 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm29327-201ENSMUST00000188229 388 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps16-201ENSMUST00000204747 105 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC118006.1-201ENSMUST00000224211 501 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Srek1-204ENSMUST00000210489 6330 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr1033-204ENSMUST00000215682 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f5-201ENSMUST00000179538 1950 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr1229-202ENSMUST00000213883 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr112-204ENSMUST00000208832 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm26279-201ENSMUST00000157095 102 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm29155-202ENSMUST00000186289 216 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm7449-201ENSMUST00000194393 663 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm43704-201ENSMUST00000196164 496 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm45553-201ENSMUST00000209929 507 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm30409-201ENSMUST00000223302 229 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC100209.2-201ENSMUST00000224461 451 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mir208a-201ENSMUST00000083498 83 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Oog1-202ENSMUST00000222112 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 2210418O10Rik-203ENSMUST00000136719 2314 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r30-203ENSMUST00000227466 1798 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r71-205ENSMUST00000227940 4725 ntAPPRIS P2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC124561.2-201ENSMUST00000226657 1973 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Tenm1-202ENSMUST00000115058 12837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm26367-201ENSMUST00000104165 132 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm24067-201ENSMUST00000104514 85 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mdga2-203ENSMUST00000113942 423 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm12722-201ENSMUST00000118507 493 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm16032-201ENSMUST00000118534 168 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm24392-201ENSMUST00000158136 103 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm22381-201ENSMUST00000158186 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm24667-201ENSMUST00000158938 103 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm28848-201ENSMUST00000189984 168 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm37050-201ENSMUST00000193464 466 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 AC133189.2-201ENSMUST00000228527 392 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 2210407C18Rik-201ENSMUST00000048801 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
Rabgef1Q9JM13 Mir383-201ENSMUST00000083523 70 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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