Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm27607-201ENSMUST00000185162 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm6369-201ENSMUST00000069626 412 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Mir3096-201ENSMUST00000116685 71 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm11998-201ENSMUST00000146304 972 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm23588-201ENSMUST00000157659 99 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps33-201ENSMUST00000175691 904 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20619-204ENSMUST00000181343 786 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20883-201ENSMUST00000185245 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21117-202ENSMUST00000185327 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20916-202ENSMUST00000185338 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm28897-201ENSMUST00000185340 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20736-202ENSMUST00000185550 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20835-201ENSMUST00000185565 923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm29564-201ENSMUST00000185575 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm29299-201ENSMUST00000185609 923 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21317-201ENSMUST00000185636 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21095-202ENSMUST00000185776 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm28553-201ENSMUST00000185924 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20908-201ENSMUST00000186004 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20929-201ENSMUST00000186578 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20888-202ENSMUST00000186890 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21518-202ENSMUST00000186938 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20855-202ENSMUST00000186996 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20911-201ENSMUST00000187135 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm28102-201ENSMUST00000187146 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm28827-201ENSMUST00000187165 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20931-202ENSMUST00000187293 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21760-202ENSMUST00000187433 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20920-201ENSMUST00000187477 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21627-201ENSMUST00000187768 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20850-201ENSMUST00000188672 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21488-201ENSMUST00000188744 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20820-201ENSMUST00000188754 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20894-201ENSMUST00000188864 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr783-ps1-201ENSMUST00000205105 441 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm19709-201ENSMUST00000215403 482 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr853-201ENSMUST00000058296 918 ntAPPRIS P1 BASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm26439-201ENSMUST00000082592 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm8935-202ENSMUST00000105727 1959 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14797-201ENSMUST00000119378 1480 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Pate3-201ENSMUST00000178236 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm23126-201ENSMUST00000104260 134 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm12016-201ENSMUST00000119079 681 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm15656-201ENSMUST00000132076 615 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm11583-201ENSMUST00000132296 466 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Trbv6-201ENSMUST00000193743 276 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm37027-201ENSMUST00000194642 256 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm38167-201ENSMUST00000195704 1178 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 AC164629.1-201ENSMUST00000220250 1113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr1461-201ENSMUST00000053772 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms