Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm26278-201ENSMUST00000157098 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm25373-201ENSMUST00000158156 115 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm25902-201ENSMUST00000158493 318 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Lce6a-202ENSMUST00000170676 485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm23660-201ENSMUST00000178362 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm24088-201ENSMUST00000179100 79 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm23793-201ENSMUST00000179396 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm23862-201ENSMUST00000180342 94 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm27648-201ENSMUST00000184315 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm38019-201ENSMUST00000195133 380 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Igkv9-128-201ENSMUST00000196602 353 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44654-201ENSMUST00000208052 329 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm5023-201ENSMUST00000217442 587 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 S100z-201ENSMUST00000022186 399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC154521.1-201ENSMUST00000222635 330 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm25929-201ENSMUST00000082784 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44230-201ENSMUST00000203032 3550 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Zfp971-202ENSMUST00000108926 1413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Zfp280c-204ENSMUST00000114940 3863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr352-202ENSMUST00000217325 3337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r185-202ENSMUST00000226694 5656 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Macc1-203ENSMUST00000221917 4272 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm16155-201ENSMUST00000155180 338 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22038-201ENSMUST00000157277 242 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm24577-201ENSMUST00000158580 63 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22891-201ENSMUST00000158641 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Ear10-201ENSMUST00000159175 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm27608-201ENSMUST00000184822 162 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm43812-201ENSMUST00000200976 581 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Dpp10-201ENSMUST00000112603 4477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm42675-201ENSMUST00000197552 4035 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr124-204ENSMUST00000217365 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm44150-201ENSMUST00000203317 2619 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm13711-201ENSMUST00000119708 453 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm13601-201ENSMUST00000142314 404 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm23470-201ENSMUST00000157129 120 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22216-201ENSMUST00000157557 114 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm20534-201ENSMUST00000172957 172 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm37616-201ENSMUST00000193974 322 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 AC122905.2-201ENSMUST00000220325 269 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Scgb1a1-201ENSMUST00000025554 476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22249-201ENSMUST00000082485 136 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr355-202ENSMUST00000213574 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr394-203ENSMUST00000216608 5628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
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