Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ccdc7b-201ENSMUST00000026912 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm43439-201ENSMUST00000138710 322 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Trav20-201ENSMUST00000142754 347 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm16349-201ENSMUST00000149990 394 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 2210417A02Rik-201ENSMUST00000150265 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Ear-ps8-201ENSMUST00000161935 354 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm6660-201ENSMUST00000179149 468 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm42647-201ENSMUST00000195939 459 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm42739-201ENSMUST00000200687 226 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm44024-201ENSMUST00000203008 476 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm45754-201ENSMUST00000212380 279 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 4930567K20Rik-203ENSMUST00000220108 646 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC159232.1-201ENSMUST00000222297 580 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Tslp-201ENSMUST00000025237 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm24151-201ENSMUST00000082758 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Mir107-201ENSMUST00000083660 87 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm10192-201ENSMUST00000086672 327 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 2410141K09Rik-201ENSMUST00000091541 288 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm23741-201ENSMUST00000097237 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
Rpl28P41105 AC125532.1-201ENSMUST00000216210 2334 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm14931-201ENSMUST00000111079 253 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm22091-201ENSMUST00000116908 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm15281-201ENSMUST00000125181 351 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm22186-201ENSMUST00000157822 122 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Snord11-201ENSMUST00000158468 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 9130015A21Rik-201ENSMUST00000221491 651 ntTSL 2 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm12580-201ENSMUST00000127456 1751 ntTSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr606-203ENSMUST00000217250 2313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm42942-201ENSMUST00000196086 1328 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 n-R5s200-201ENSMUST00000104194 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm11786-201ENSMUST00000120799 155 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm16328-201ENSMUST00000126985 196 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm16218-201ENSMUST00000155424 388 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 U6.1-201ENSMUST00000157443 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm22765-201ENSMUST00000158371 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm25711-201ENSMUST00000158633 128 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm17377-201ENSMUST00000165184 207 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm18416-201ENSMUST00000175635 1003 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Vmn1r-ps24-201ENSMUST00000175772 900 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Vmn2r-ps34-201ENSMUST00000177433 904 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm29429-201ENSMUST00000187071 121 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm42604-201ENSMUST00000200077 801 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm46136-201ENSMUST00000214730 565 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm23246-201ENSMUST00000083371 67 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm26166-201ENSMUST00000083788 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
Rpl28P41105 Gm3563-201ENSMUST00000172963 1628 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms