Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm12806-201ENSMUST00000119384 268 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Acer3-202ENSMUST00000120520 3964 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14362-201ENSMUST00000121679 273 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24839-201ENSMUST00000122602 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15254-201ENSMUST00000149567 273 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24438-201ENSMUST00000157893 115 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Vmn1r-ps68-201ENSMUST00000174638 399 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm27532-201ENSMUST00000183726 113 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm29413-201ENSMUST00000186019 880 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28870-201ENSMUST00000187033 880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm29639-201ENSMUST00000188375 580 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28404-201ENSMUST00000190242 453 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm43731-201ENSMUST00000196150 666 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Mir6925-201ENSMUST00000197857 70 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm44011-201ENSMUST00000203336 394 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Rpl26-ps1-201ENSMUST00000213139 426 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AL935138.1-201ENSMUST00000215309 196 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 4930469B13Rik-202ENSMUST00000224808 348 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Cysltr1-201ENSMUST00000064892 1059 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr394-201ENSMUST00000071478 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm26108-201ENSMUST00000083973 191 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm34240-201ENSMUST00000192500 1936 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Trdn-201ENSMUST00000095762 4514 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm6568-201ENSMUST00000122274 697 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23889-201ENSMUST00000122689 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm26414-201ENSMUST00000157674 269 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm26401-201ENSMUST00000158502 76 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25163-201ENSMUST00000158905 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24168-201ENSMUST00000178825 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28779-201ENSMUST00000189678 323 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm29553-201ENSMUST00000189692 279 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Ttn-225ENSMUST00000190813 300 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Trbv18-201ENSMUST00000194256 294 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr1285-201ENSMUST00000208523 903 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AL772265.1-201ENSMUST00000214379 305 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm35558-203ENSMUST00000222264 204 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC192333.2-201ENSMUST00000224771 196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm26263-201ENSMUST00000083281 164 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Usp9y-201ENSMUST00000091188 8094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24122-201ENSMUST00000104107 132 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14013-201ENSMUST00000119006 270 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14593-201ENSMUST00000119948 294 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14629-201ENSMUST00000122428 144 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15218-201ENSMUST00000131006 618 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25066-201ENSMUST00000158145 123 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15562-201ENSMUST00000161397 426 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25939-201ENSMUST00000179876 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28900-201ENSMUST00000185232 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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