Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

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Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26979-201ENSMUST00000182971 217 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm29139-201ENSMUST00000185794 248 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm42526-201ENSMUST00000198956 393 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22620-201ENSMUST00000082700 133 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45039-201ENSMUST00000209181 3477 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr298-204ENSMUST00000217110 3549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mga-202ENSMUST00000079934 13304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr665-204ENSMUST00000216971 3248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1496-202ENSMUST00000209137 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gpr174-203ENSMUST00000118820 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm4567-202ENSMUST00000190554 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10668-202ENSMUST00000191073 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24172-201ENSMUST00000104127 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm25315-201ENSMUST00000116823 121 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm15026-201ENSMUST00000119219 458 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir1898-201ENSMUST00000122643 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22380-201ENSMUST00000157479 95 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mir1934-201ENSMUST00000158127 83 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5967-201ENSMUST00000172723 494 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ptma-ps1-201ENSMUST00000181079 309 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm27332-201ENSMUST00000184893 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700029M03Rik-201ENSMUST00000187300 444 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20257-202ENSMUST00000188643 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm30341-201ENSMUST00000194363 289 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44419-201ENSMUST00000203338 229 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC160962.2-201ENSMUST00000224761 632 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Defb33-201ENSMUST00000098908 424 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1216-202ENSMUST00000216000 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1354-202ENSMUST00000204587 3781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1354-203ENSMUST00000217073 3792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Strbp-201ENSMUST00000028279 16348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43958-201ENSMUST00000204360 3544 ntBASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scgb1b24-201ENSMUST00000108087 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44794-201ENSMUST00000206550 411 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC107864.1-201ENSMUST00000217937 496 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm10298-201ENSMUST00000074801 265 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tsga10-204ENSMUST00000123082 3953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43883-201ENSMUST00000204002 3750 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm23142-201ENSMUST00000101848 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26240-201ENSMUST00000101893 105 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trav7n-4-201ENSMUST00000103609 341 ntAPPRIS P1 BASIC2.57□□□□□ -2
Trbv13-1A0A0B4J1P8 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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