Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm12881-201ENSMUST00000121191 203 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 1700063H06Rik-201ENSMUST00000183678 445 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm45268-201ENSMUST00000210046 370 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr534-ps1-201ENSMUST00000211776 870 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Hspe1-ps2-201ENSMUST00000051437 312 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr728-201ENSMUST00000051563 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Olfr1253-203ENSMUST00000215185 4984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Gm45263-201ENSMUST00000210377 1375 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm15125-201ENSMUST00000116185 800 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm22960-201ENSMUST00000122517 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm1989-201ENSMUST00000126244 636 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Esp18-201ENSMUST00000179848 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Mir6351-201ENSMUST00000183826 99 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm8403-201ENSMUST00000189712 1298 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 AC160123.1-201ENSMUST00000213443 570 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr1059-ps1-201ENSMUST00000215214 586 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr197-202ENSMUST00000207772 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14879-201ENSMUST00000117308 507 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm11935-201ENSMUST00000118608 399 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm26049-201ENSMUST00000157313 108 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps53-201ENSMUST00000173066 922 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm37578-201ENSMUST00000192256 1177 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-62-1-201ENSMUST00000198690 317 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm45530-201ENSMUST00000211658 225 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 AC152979.4-201ENSMUST00000219893 379 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm3333-202ENSMUST00000221763 1044 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr807-201ENSMUST00000059038 997 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Mir421-201ENSMUST00000083575 76 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr820-203ENSMUST00000215791 3956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm7489-201ENSMUST00000100666 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 AU041133-201ENSMUST00000105314 1494 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm22386-201ENSMUST00000158192 129 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr757-ps1-201ENSMUST00000172798 413 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm24080-201ENSMUST00000175178 232 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm38231-201ENSMUST00000192030 347 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm38281-201ENSMUST00000192301 315 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm42834-201ENSMUST00000196845 256 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm17911-201ENSMUST00000210806 877 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Sult2a8-201ENSMUST00000063509 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Skint2-203ENSMUST00000106560 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm13087-201ENSMUST00000118298 256 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14600-201ENSMUST00000121032 630 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm9001-201ENSMUST00000121642 399 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Mir3112-201ENSMUST00000175431 82 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Sprr2c-ps-201ENSMUST00000195581 301 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Mir703-201ENSMUST00000197105 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm30784-201ENSMUST00000204491 794 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Olfr141-201ENSMUST00000216117 2935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14910-201ENSMUST00000121037 1805 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Col5a3Q9JLI2 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.3 ms