Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm37128-201ENSMUST00000192599 232 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm39038-201ENSMUST00000206774 355 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm36776-201ENSMUST00000207006 203 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm45704-201ENSMUST00000212582 403 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 2900042G08Rik-201ENSMUST00000221776 650 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm10553-201ENSMUST00000097669 372 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 A630033H20Rik-205ENSMUST00000167673 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Mir499-201ENSMUST00000102357 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Snord98-201ENSMUST00000116819 65 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm11363-201ENSMUST00000121672 548 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm14389-201ENSMUST00000140453 241 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm23779-201ENSMUST00000157938 64 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm23047-201ENSMUST00000177661 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm24618-201ENSMUST00000177718 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm23953-201ENSMUST00000178214 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm25360-201ENSMUST00000178786 191 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm26332-201ENSMUST00000179813 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm22863-201ENSMUST00000180265 94 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Mir8096-201ENSMUST00000184526 127 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm40040-202ENSMUST00000196337 305 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Igkv8-31-201ENSMUST00000200040 372 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm42468-201ENSMUST00000200360 703 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 AC164100.1-201ENSMUST00000227214 508 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 AC170600.1-201ENSMUST00000228763 277 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Defb9-201ENSMUST00000057076 310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Ms4a14-201ENSMUST00000187467 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1258-201ENSMUST00000102609 7007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Olfr199-202ENSMUST00000214186 2728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1211-204ENSMUST00000215205 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm44715-201ENSMUST00000209049 3839 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm42755-201ENSMUST00000198533 1493 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm43300-201ENSMUST00000198540 2043 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm16024-201ENSMUST00000128841 171 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm27999-201ENSMUST00000183539 193 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm27245-201ENSMUST00000184385 376 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm19620-201ENSMUST00000195972 434 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Mir7227-201ENSMUST00000200408 59 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
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Pggt1bQ8BUY9 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm25410-201ENSMUST00000083758 137 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Olfr142-202ENSMUST00000213968 3630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm17969-201ENSMUST00000185706 2557 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Tex16-201ENSMUST00000038546 3972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Olfr509-204ENSMUST00000215075 3418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r77-204ENSMUST00000228213 8094 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm14269-201ENSMUST00000120455 306 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm15799-201ENSMUST00000120899 289 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm15903-201ENSMUST00000155796 310 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm25184-201ENSMUST00000157753 163 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
Pggt1bQ8BUY9 Gm24811-201ENSMUST00000175313 100 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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