Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm13602-201ENSMUST00000122405 493 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm21913-201ENSMUST00000179880 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm27028-201ENSMUST00000182303 399 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Mir7062-201ENSMUST00000185038 66 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm28494-201ENSMUST00000187687 562 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm18775-201ENSMUST00000190763 586 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm43804-201ENSMUST00000198280 456 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm44410-201ENSMUST00000203151 341 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm45013-201ENSMUST00000206883 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 1700008P02Rik-201ENSMUST00000091364 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Rps24-ps3-201ENSMUST00000118723 402 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm17072-201ENSMUST00000166673 658 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Zfp813-ps-202ENSMUST00000204773 618 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm45366-201ENSMUST00000209828 384 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr662-ps1-201ENSMUST00000210704 396 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 CT010506.2-201ENSMUST00000225618 183 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1086-201ENSMUST00000099878 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm38162-201ENSMUST00000195562 4597 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm12510-201ENSMUST00000152190 362 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm23981-201ENSMUST00000157136 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm24784-201ENSMUST00000157640 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm25460-201ENSMUST00000157954 127 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm18296-201ENSMUST00000192475 783 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm37119-201ENSMUST00000195691 389 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Olfr278-ps1-201ENSMUST00000205676 238 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm44923-201ENSMUST00000206673 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm38405-203ENSMUST00000208548 400 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC122194.1-201ENSMUST00000220549 293 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 CT025579.1-201ENSMUST00000223779 366 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 AC154262.1-201ENSMUST00000225976 286 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Vipas39Q8BGQ1 C230088H06Rik-202ENSMUST00000181752 3010 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Zfp273-201ENSMUST00000012725 2277 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm45558-201ENSMUST00000209384 1895 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm11042-201ENSMUST00000110441 120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1144-ps1-201ENSMUST00000118227 328 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 n-R5s207-201ENSMUST00000122497 118 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm24551-201ENSMUST00000158645 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm10715-202ENSMUST00000177969 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Gm27919-201ENSMUST00000185163 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 Olfr941-ps1-201ENSMUST00000215258 935 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Vipas39Q8BGQ1 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms