Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 AC124356.2-201ENSMUST00000221874 336 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm24258-201ENSMUST00000083739 133 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm25099-201ENSMUST00000093716 116 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Olfr136-204ENSMUST00000214035 1925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm26105-201ENSMUST00000157253 190 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Mucl2-202ENSMUST00000226584 823 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm23605-201ENSMUST00000157255 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm45173-201ENSMUST00000206819 305 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Sycp1-ps1-201ENSMUST00000207882 2768 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm26285-201ENSMUST00000177923 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm23622-201ENSMUST00000082460 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm16546-201ENSMUST00000159442 355 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm20630-201ENSMUST00000177387 551 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm26960-201ENSMUST00000182263 412 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
Ccdc18Q640L5 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm24304-201ENSMUST00000177635 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm28054-201ENSMUST00000187280 872 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm38060-201ENSMUST00000194822 464 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 1700024I08Rik-202ENSMUST00000222074 407 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.15□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm14591-201ENSMUST00000120407 518 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm44384-201ENSMUST00000200208 114 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Olfr192-202ENSMUST00000205727 1141 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Sval1-201ENSMUST00000031898 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Olfr498-201ENSMUST00000217616 2260 ntAPPRIS P1 BASIC1.14□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm14674-201ENSMUST00000117816 342 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps69-201ENSMUST00000172759 201 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm25996-201ENSMUST00000175393 117 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Nrg3os-201ENSMUST00000177141 927 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 CT009718.1-201ENSMUST00000220784 395 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm25541-201ENSMUST00000116888 126 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Olfr454-ps1-201ENSMUST00000205206 348 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 AC093316.1-201ENSMUST00000218793 529 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 AC116395.1-201ENSMUST00000225480 1143 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 2900092C05Rik-201ENSMUST00000032541 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 5430435K18Rik-201ENSMUST00000202597 661 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm14073-201ENSMUST00000117344 381 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Defa-ps6-201ENSMUST00000122172 282 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm23429-201ENSMUST00000122486 149 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm44182-201ENSMUST00000204052 115 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 n-R5s158-201ENSMUST00000104095 118 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm11784-201ENSMUST00000118568 474 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm22082-201ENSMUST00000157587 161 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm23994-201ENSMUST00000158059 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm22646-201ENSMUST00000175130 115 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm25683-201ENSMUST00000083940 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
Ccdc18Q640L5 Gm2003-201ENSMUST00000118537 636 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Gm22482-201ENSMUST00000122563 359 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Trav5d-3-201ENSMUST00000170041 270 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Gm43043-201ENSMUST00000196579 412 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 CT030166.3-201ENSMUST00000223203 193 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Gm43021-201ENSMUST00000198692 337 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Ccdc18Q640L5 CT010480.5-201ENSMUST00000225026 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms