Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Zfp932-207ENSMUST00000187241 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 2610300M13Rik-202ENSMUST00000203716 1787 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm22674-201ENSMUST00000104413 131 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Sult2a-ps3-201ENSMUST00000117899 428 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm16171-201ENSMUST00000118004 324 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm14848-201ENSMUST00000121850 467 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm20543-201ENSMUST00000174200 726 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm24086-201ENSMUST00000175171 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm37007-201ENSMUST00000194234 319 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm9227-201ENSMUST00000194733 566 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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Ccdc185Q3V118 Gm19140-201ENSMUST00000209790 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm24045-201ENSMUST00000083113 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm45257-201ENSMUST00000210301 3998 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Olfr623-202ENSMUST00000213840 3980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm44821-201ENSMUST00000208212 2002 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Trbv30-201ENSMUST00000103282 332 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm15807-201ENSMUST00000119880 1128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm29597-201ENSMUST00000188035 308 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm29591-201ENSMUST00000188215 357 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm36406-202ENSMUST00000203761 551 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm7495-201ENSMUST00000215099 426 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ccdc185Q3V118 CT009713.6-201ENSMUST00000223615 294 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 AC124524.1-201ENSMUST00000225833 181 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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Ccdc185Q3V118 Zfp953-201ENSMUST00000081582 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Olfr640-202ENSMUST00000218535 4009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Ccdc178-201ENSMUST00000025160 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
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Ccdc185Q3V118 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Zfp280c-202ENSMUST00000076635 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Zfp97-201ENSMUST00000147630 2684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 N4bp2l2-201ENSMUST00000118316 8982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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Ccdc185Q3V118 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm6806-201ENSMUST00000120092 1006 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Vmn1r-ps116-201ENSMUST00000121544 292 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm22651-201ENSMUST00000157872 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm22611-201ENSMUST00000158288 150 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm24681-201ENSMUST00000158760 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
Ccdc185Q3V118 Gm37029-201ENSMUST00000195773 239 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.2 ms