Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Klra3-201ENSMUST00000088017 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr592-203ENSMUST00000218618 5978 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr124-203ENSMUST00000216478 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19428-201ENSMUST00000220512 1995 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Rps27-ps1-201ENSMUST00000118179 246 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13541-201ENSMUST00000119519 283 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23000-201ENSMUST00000157083 139 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23169-201ENSMUST00000157157 112 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26180-201ENSMUST00000179942 107 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28700-201ENSMUST00000187614 579 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28534-201ENSMUST00000187744 676 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43472-201ENSMUST00000200175 154 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44600-201ENSMUST00000208540 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 1700015C15Rik-201ENSMUST00000221465 374 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23404-201ENSMUST00000082543 97 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Defa25-201ENSMUST00000095425 279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1094-202ENSMUST00000217509 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdh11x-206ENSMUST00000192677 9097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 P2ry10-202ENSMUST00000118666 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Trav16n-201ENSMUST00000103633 353 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25539-201ENSMUST00000116886 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14971-201ENSMUST00000117980 663 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12954-201ENSMUST00000118610 611 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13153-201ENSMUST00000120969 637 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6265-201ENSMUST00000149263 231 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25827-201ENSMUST00000157089 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24191-201ENSMUST00000157977 122 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10105-201ENSMUST00000184601 270 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 4930596I21Rik-201ENSMUST00000200494 461 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44157-201ENSMUST00000204720 410 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44825-201ENSMUST00000207557 150 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44598-201ENSMUST00000207566 150 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7240-201ENSMUST00000220769 664 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr348-201ENSMUST00000056865 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr1340-201ENSMUST00000094834 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43879-201ENSMUST00000203811 3760 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8300-201ENSMUST00000110152 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm24671-201ENSMUST00000104159 158 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm29231-201ENSMUST00000179850 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm27624-201ENSMUST00000185047 177 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr210-ps1-201ENSMUST00000203138 905 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 AC117202.2-201ENSMUST00000226491 1101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Btla-202ENSMUST00000102802 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42684-201ENSMUST00000197663 3615 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Nkx6-3Q3UHX8 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms