Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r13-203ENSMUST00000227298 5203 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm23422-201ENSMUST00000102000 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm22021-201ENSMUST00000104353 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm11854-201ENSMUST00000117839 446 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm14972-201ENSMUST00000121780 364 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm22085-201ENSMUST00000158344 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm16038-201ENSMUST00000159317 193 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21842-201ENSMUST00000177552 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21626-201ENSMUST00000177791 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21562-201ENSMUST00000177888 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21539-201ENSMUST00000177925 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm17469-201ENSMUST00000177942 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm17693-201ENSMUST00000178004 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm17361-201ENSMUST00000178121 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm17522-201ENSMUST00000178144 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21599-201ENSMUST00000178249 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21616-201ENSMUST00000178416 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21914-201ENSMUST00000178452 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm17584-201ENSMUST00000178471 498 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21723-201ENSMUST00000178692 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21916-201ENSMUST00000178771 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21801-201ENSMUST00000178865 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21633-201ENSMUST00000178941 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm17267-201ENSMUST00000178952 499 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21821-201ENSMUST00000179646 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21588-201ENSMUST00000180074 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21780-201ENSMUST00000180128 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21572-201ENSMUST00000180134 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm21529-201ENSMUST00000180175 498 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm29370-202ENSMUST00000187476 499 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm36992-201ENSMUST00000195463 428 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm43614-201ENSMUST00000197030 517 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1481-ps1-201ENSMUST00000207312 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm45730-201ENSMUST00000212560 395 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Olfr937-201ENSMUST00000055567 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm10800-201ENSMUST00000099683 660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1042-201ENSMUST00000099908 4119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm2042-201ENSMUST00000110145 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Zfp987-201ENSMUST00000091878 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1193-203ENSMUST00000216767 3690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Igkv5-39-201ENSMUST00000103370 287 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm16216-201ENSMUST00000118970 1111 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm14287-201ENSMUST00000121060 117 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm22479-201ENSMUST00000122566 81 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm26088-201ENSMUST00000157896 131 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm22101-201ENSMUST00000157928 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm23380-201ENSMUST00000158448 103 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm20484-201ENSMUST00000173738 231 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm28008-201ENSMUST00000184021 186 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm29658-201ENSMUST00000185404 230 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-17-1-201ENSMUST00000194849 351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Olfr468-ps1-201ENSMUST00000207203 593 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 AC132437.1-201ENSMUST00000218308 320 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Ssbp4Q3U4B1 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 5330434G04Rik-203ENSMUST00000142109 3449 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Tcrg-V5-201ENSMUST00000103556 293 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm7164-201ENSMUST00000117503 450 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm11598-201ENSMUST00000119257 357 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
Ssbp4Q3U4B1 Cdrt4os2-201ENSMUST00000128675 494 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
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