Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Defb21-201ENSMUST00000070722 427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Skint5-202ENSMUST00000169631 4497 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm43473-201ENSMUST00000200442 5997 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm12825-201ENSMUST00000120249 563 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm25368-201ENSMUST00000158847 131 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm28688-201ENSMUST00000187301 268 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 AC113305.1-201ENSMUST00000214664 724 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 AC163289.1-201ENSMUST00000215919 262 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm46994-201ENSMUST00000221523 219 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm5955-201ENSMUST00000222712 219 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Tas2r114-201ENSMUST00000080619 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Mir125b-2-201ENSMUST00000083538 71 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm25411-201ENSMUST00000083760 151 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Olfr921-203ENSMUST00000217114 4120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Traj39-201ENSMUST00000103703 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm12044-201ENSMUST00000120335 213 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Scgb1b26-ps-201ENSMUST00000121845 291 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm25961-201ENSMUST00000157174 135 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm16004-201ENSMUST00000161981 311 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Ranbp2-ps8-201ENSMUST00000183723 345 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm37630-201ENSMUST00000194210 1456 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm11060-201ENSMUST00000111107 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm13728-201ENSMUST00000117471 400 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm15110-201ENSMUST00000117545 881 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm21962-201ENSMUST00000166899 1017 ntAPPRIS P1 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 C920009B18Rik-204ENSMUST00000181733 123 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm9892-201ENSMUST00000182415 992 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm37000-201ENSMUST00000193058 428 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 D030025E07Rik-205ENSMUST00000198478 418 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Olfr385-202ENSMUST00000215689 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm16306-201ENSMUST00000160568 176 ntTSL 3 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm24572-201ENSMUST00000175505 88 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm22584-201ENSMUST00000177935 92 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm27959-201ENSMUST00000185172 111 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm9377-201ENSMUST00000207227 623 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm8940-201ENSMUST00000212585 219 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm6109-201ENSMUST00000223297 348 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
Cpne9Q1RLL3 Mir669d-201ENSMUST00000104644 121 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm12272-201ENSMUST00000138136 333 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm10177-202ENSMUST00000161698 207 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm17085-201ENSMUST00000165425 502 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
Cpne9Q1RLL3 Gm17689-201ENSMUST00000170030 330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
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