Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm25485-201ENSMUST00000104120 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14868-201ENSMUST00000117840 216 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm25392-201ENSMUST00000157335 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26271-201ENSMUST00000158349 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm25413-201ENSMUST00000158544 312 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm24044-201ENSMUST00000083107 156 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Zfy2-201ENSMUST00000115891 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Catsperb-201ENSMUST00000055156 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm12513-201ENSMUST00000118617 352 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm6444-201ENSMUST00000119611 458 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps132-201ENSMUST00000176738 651 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm24137-201ENSMUST00000180055 79 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm22391-201ENSMUST00000180356 79 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Zfp640-202ENSMUST00000224116 1562 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr1442-202ENSMUST00000207341 3126 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr1442-204ENSMUST00000208657 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr479-202ENSMUST00000209805 2902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 AC122887.2-201ENSMUST00000219465 1603 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr1039-203ENSMUST00000216566 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm22554-201ENSMUST00000157798 147 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm24858-201ENSMUST00000158058 323 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Mir3964-201ENSMUST00000174898 74 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm20058-201ENSMUST00000186939 284 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm43402-201ENSMUST00000197159 159 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Igkv13-64-201ENSMUST00000198143 343 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Olfr991-ps1-201ENSMUST00000215967 908 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 AC159632.1-201ENSMUST00000221808 317 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 AC138667.2-201ENSMUST00000224880 598 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Tlr8-201ENSMUST00000049023 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
Traf3ip1Q149C2 Gm25090-201ENSMUST00000104000 132 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm14435-203ENSMUST00000172025 192 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm29817-201ENSMUST00000210098 172 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm32300-201ENSMUST00000221735 515 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm14440-201ENSMUST00000098998 192 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm13876-201ENSMUST00000118451 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Traf3ip1Q149C2 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms