Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Gm18441-201ENSMUST00000223539 617 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtpreP49446 AC159252.1-201ENSMUST00000224450 553 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtpreP49446 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm22576-201ENSMUST00000083733 104 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtpreP49446 AC153964.1-201ENSMUST00000219677 3142 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Slc31a1-202ENSMUST00000122092 4154 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PtpreP49446 A230057D06Rik-203ENSMUST00000208953 3357 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 AC155805.1-201ENSMUST00000222419 3808 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Gm13567-201ENSMUST00000118026 247 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm14916-201ENSMUST00000121904 204 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Ang-ps2-201ENSMUST00000178173 433 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm5876-201ENSMUST00000203735 243 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Elavl4-204ENSMUST00000106598 3997 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PtpreP49446 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Fbxl17-204ENSMUST00000112840 3667 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PtpreP49446 AC158605.2-201ENSMUST00000220287 2726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Olfr1097-202ENSMUST00000217403 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm15624-203ENSMUST00000204811 3402 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm5117-201ENSMUST00000178878 2553 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Oxr1-202ENSMUST00000090095 4156 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Olfr123-202ENSMUST00000214770 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm18015-201ENSMUST00000214879 316 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 n-R5s162-201ENSMUST00000082581 119 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Vmn1r58-201ENSMUST00000108569 10140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 mt-Tf-201ENSMUST00000082387 68 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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PtpreP49446 Btbd35f17-201ENSMUST00000105014 1960 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtpreP49446 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Xirp2-202ENSMUST00000112347 11979 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PtpreP49446 Gm8674-201ENSMUST00000179367 3047 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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