Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Smr3a-202ENSMUST00000189633 467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 A930014E01Rik-201ENSMUST00000194572 330 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm2676-201ENSMUST00000207279 606 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 4930402F11Rik-202ENSMUST00000207781 1178 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC159475.1-201ENSMUST00000216752 411 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Mir124a-3-201ENSMUST00000083520 68 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr896-ps1-203ENSMUST00000216276 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr1466-202ENSMUST00000207124 1981 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Sult2a-ps4-201ENSMUST00000121421 386 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23956-201ENSMUST00000157211 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Vmn1r-ps47-201ENSMUST00000176694 907 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Ranbp2-ps4-201ENSMUST00000183481 385 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Trbv24-201ENSMUST00000194614 347 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm29950-201ENSMUST00000195273 237 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm19202-201ENSMUST00000198096 808 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm42164-201ENSMUST00000198881 379 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 CT025619.4-201ENSMUST00000217362 350 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 4930455B14Rik-203ENSMUST00000223613 640 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 CT030182.3-201ENSMUST00000225986 582 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr786-201ENSMUST00000076508 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr1461-202ENSMUST00000207113 3481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 n-R5s164-201ENSMUST00000122664 112 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm15718-201ENSMUST00000131085 311 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 H3f3aos-202ENSMUST00000159740 229 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Rpl26-ps4-201ENSMUST00000170279 438 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm9022-202ENSMUST00000183285 483 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Mir7k-201ENSMUST00000184115 110 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm28597-201ENSMUST00000187664 666 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Rpl23a-ps9-201ENSMUST00000188369 463 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Rpl23a-ps11-201ENSMUST00000191583 463 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm2719-201ENSMUST00000191929 444 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm44181-201ENSMUST00000203106 483 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm45288-201ENSMUST00000210236 151 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC159203.2-201ENSMUST00000221326 193 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC173345.1-201ENSMUST00000222837 306 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Defb37-201ENSMUST00000066282 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Tgif2lx2-201ENSMUST00000072518 1030 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Tgif2lx1-201ENSMUST00000073857 1030 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm26228-201ENSMUST00000082512 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25080-201ENSMUST00000082526 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm25518-201ENSMUST00000083864 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm44527-201ENSMUST00000182210 2945 ntTSL 2 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Ccl20O89093 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms