Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm24862-201ENSMUST00000179103 79 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm23310-201ENSMUST00000179105 79 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm25461-201ENSMUST00000179293 79 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm25528-201ENSMUST00000180264 132 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Trav7-4-201ENSMUST00000181728 451 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm8739-201ENSMUST00000185962 181 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Olfr1435-ps1-201ENSMUST00000207773 249 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 AC105958.2-201ENSMUST00000214167 191 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 AC069074.2-201ENSMUST00000217819 428 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 AC122484.1-201ENSMUST00000221578 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 AC241593.1-201ENSMUST00000224768 397 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm5239-201ENSMUST00000081864 369 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm15697-201ENSMUST00000121946 2902 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Opn1mwO35599 Gm38211-201ENSMUST00000192814 7217 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm7327-201ENSMUST00000120925 652 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm12779-201ENSMUST00000121496 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm22500-201ENSMUST00000158982 99 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm7097-201ENSMUST00000161841 491 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm27582-201ENSMUST00000184084 126 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm28000-201ENSMUST00000184380 85 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gtpbp4-ps6-201ENSMUST00000198160 292 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm43367-201ENSMUST00000199986 625 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Igkv2-95-1-201ENSMUST00000200279 272 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm12128-201ENSMUST00000131013 2914 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Muc16-204ENSMUST00000208663 25437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr1052-203ENSMUST00000217166 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm22750-201ENSMUST00000102076 103 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Mir693-201ENSMUST00000102187 89 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm13596-201ENSMUST00000153354 292 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr103-202ENSMUST00000173472 3079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr821-201ENSMUST00000054364 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr1222-202ENSMUST00000214027 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm11065-201ENSMUST00000111462 228 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm25318-201ENSMUST00000122554 314 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 4930579O11Rik-202ENSMUST00000168243 672 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm29134-201ENSMUST00000186579 126 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm28337-201ENSMUST00000190425 666 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm23128-202ENSMUST00000196578 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm43550-201ENSMUST00000200597 303 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm44336-201ENSMUST00000203696 468 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm45312-201ENSMUST00000210566 311 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 Gm18000-201ENSMUST00000212153 800 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
Opn1mwO35599 AC147101.1-201ENSMUST00000217964 312 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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