Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm44012-201ENSMUST00000204154 424 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC124346.1-201ENSMUST00000218539 364 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC159188.1-201ENSMUST00000225198 526 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm23650-201ENSMUST00000083355 70 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Fam81b-201ENSMUST00000208418 2760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr1318-202ENSMUST00000214063 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Zfp40-206ENSMUST00000172177 2736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr186-203ENSMUST00000216415 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Trav7-2-201ENSMUST00000103636 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm26247-201ENSMUST00000116702 91 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm22032-201ENSMUST00000116946 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm11414-201ENSMUST00000121795 263 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm26402-201ENSMUST00000158499 113 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 2310075C17Rik-201ENSMUST00000161216 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Mir5129-201ENSMUST00000174938 78 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm21797-201ENSMUST00000177579 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm21767-201ENSMUST00000178689 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm21822-201ENSMUST00000179302 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 2310010J17Rik-201ENSMUST00000181189 490 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm43355-201ENSMUST00000196541 346 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Trav7d-2-201ENSMUST00000200127 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm44425-201ENSMUST00000203739 429 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm19177-201ENSMUST00000204520 613 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 5430401H09Rik-201ENSMUST00000218145 1076 ntTSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 CT485612.2-201ENSMUST00000223014 151 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Lrrc19-201ENSMUST00000053419 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Zfp990-202ENSMUST00000105742 2996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Olfr839-ps1-201ENSMUST00000212127 7759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gpr22-201ENSMUST00000057783 4587 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC2.9□□□□□ -1.94
Cldn4O35054 Gm45662-201ENSMUST00000210054 2098 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr881-202ENSMUST00000212489 4237 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Mir344c-201ENSMUST00000103919 92 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 DQ267100-201ENSMUST00000122600 72 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Tnfaip8-206ENSMUST00000145726 632 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm25624-201ENSMUST00000157222 275 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm24780-201ENSMUST00000157635 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm24879-201ENSMUST00000158386 143 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm21893-201ENSMUST00000179119 397 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm34314-201ENSMUST00000203622 367 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm44870-201ENSMUST00000207291 357 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm10717-201ENSMUST00000075573 684 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Naaladl2-202ENSMUST00000203414 9330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr772-202ENSMUST00000214672 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm14429-201ENSMUST00000121881 2024 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr878-203ENSMUST00000214263 4003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm38382-201ENSMUST00000193790 2499 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr309-202ENSMUST00000174158 3293 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Olfr1129-203ENSMUST00000214773 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Btf3l4-201ENSMUST00000102739 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm17148-201ENSMUST00000164702 249 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Mir3092-201ENSMUST00000174954 96 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Esp4-201ENSMUST00000178498 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm23191-201ENSMUST00000179147 107 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm9967-203ENSMUST00000206903 408 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 Gm19563-201ENSMUST00000222031 270 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
Cldn4O35054 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
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