Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm3550W4VSN7 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm3550W4VSN7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms