Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm17190V9GX38 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm17190V9GX38 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm17190V9GX38 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms