Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc166S4R181 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc166S4R181 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms