Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Hdac6Q9Z2V5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Hdac6Q9Z2V5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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Hdac6Q9Z2V5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Hdac6Q9Z2V5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdac6Q9Z2V5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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