Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tulp1Q9Z273 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tulp1Q9Z273 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms