Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cldn8Q9Z260 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cldn8Q9Z260 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms