Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccne2Q9Z238 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccne2Q9Z238 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms