Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trip6Q9Z1Y4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trip6Q9Z1Y4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms