Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ilf3Q9Z1X4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ilf3Q9Z1X4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms