Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ap3b1Q9Z1T1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ap3b1Q9Z1T1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms