Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ddx39bQ9Z1N5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ddx39bQ9Z1N5 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms