Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z104

Hmg20b, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20bQ9Z104 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Hmg20bQ9Z104 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Hmg20bQ9Z104 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms