Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cldn15Q9Z0S5 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn15Q9Z0S5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms