Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cldn13Q9Z0S4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Cldn13Q9Z0S4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn13Q9Z0S4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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