Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Slit3Q9WVB4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slit3Q9WVB4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms