Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV55

Vapa, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapaQ9WV55 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VapaQ9WV55 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms