Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Apobec2Q9WV35 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Apobec2Q9WV35 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms