Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnip1Q9WUU8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnip1Q9WUU8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms