Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUD1

Stub1, STIP1 homology and U box-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stub1Q9WUD1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stub1Q9WUD1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stub1Q9WUD1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms