Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf13bQ9WU72 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms