Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nrf1Q9WU00 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms