Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Skp1Q9WTX5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Skp1Q9WTX5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms